Ngày 17/02/2004 Văn phòng Chính phủ có Công văn số 710/VPCP-KTTH thông báo ý kiến của Thủ tướng Chính phủ đồng ý việc thành lập Công ty Cổ phần Chuyển mạch Tài chính Quốc gia Việt Nam và giao NHNN chỉ đạo việc thành lập Công ty.
Ngày 09/06/2004, Đại hội đồng Cổ đông sáng lập Công ty đã thống nhất thông qua Điều lệ về tổ chức và hoạt động của Công ty Cổ phần Chuyển mạch Tài chính Quốc gia Việt Nam.
Ngày 09/07/2004, Công ty đã được Thống đốc Ngân hàng Nhà nước cấp Giấy phép hoạt động nghiệp vụ thanh toán số 06/NHNN-GP.
Ngày 14/07/2004, Công ty đã được Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội cấp Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh số 0103004894.
Ngày 09/08/2004, Công ty tổ chức khai trương.
Ngày 05/09/2005, Công ty đã được Hội thẻ Ngân hàng ra Quyết định số 310/2005-HTNH V/v kết nạp thành viên Hiệp hội thẻ Ngân hàng Việt Nam, chính thức kết nạp Công ty vào Hội thẻ Ngân hàng Việt Nam.
Năm 2005, Công ty tập trung trang bị cơ sở vật chất kỹ thuật cho hệ thống chuyển mạch.
Từ tháng 4/2006 – tháng 4/2007, Công ty xây dựng Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn.
Ngày 21/04/2007: Khai trương hoạt động Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn, kết nối 3 ngân hàng đầu tiên: Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam, Ngân hàng Công thương Việt Nam và Ngân hàng TMCP Sài gòn Công thương.
Ngày 27/11/2007: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối với Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam.
Ngày 17/01/2008: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối với Ngân hàng TMCP An Bình.
Ngày 03/04/2008: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối với Ngân hàng Phát triển Nhà Đồng bằng Sông Cửu Long.
Ngày 09/05/2008: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối với Ngân hàng TMCP Nhà Hà Nội.
Ngày 23/05/2008: Banknetvn chính thức kết nối với Công ty Cổ phần Dịch vụ Thẻ Smartlink. Giai đọan kết nối này bao gồm 5 ngân hàng: Ngân hàng Ngoại thương Việt Nam (VietcomBank), Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam (Vbard), Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam (Bidv), Ngân hàng Công thương Việt nam (Vietinbank) và Ngân hàng Kỹ thương Việt Nam (Techcombank).
Tháng 9/2008: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối với Ngân hàng liên danh Việt Nga.
Quý I/2009: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn kết nối thêm 2 ngân hàng: Ngân hàng TMCP Á Châu và Ngân hàng TMCP Đại Dương.
Tháng 7/2009: Banknetvn chính thức khai trương kết nối với tổ chức chuyển mạch thẻ của Trung Quốc – China Union Pay (CUP).
Ngày 13/08/2009: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối Ngân hàng TMCP Phương Tây.
Ngày 06/11/2009: Hệ thống Chuyển mạch Banknetvn chính thức kết nối Ngân hàng TMCP Xăng dầu Petrolimex.